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浙江大学化学系始建于1915年，是我国高等学校中最早设立的化学系之一。1952年院系调整时，部分教师调入复旦大学化学系，或与之江大学化学系合并组建浙江师范学院化学系（1958年成立杭州大学化学系）。1957年浙江大学恢复化学系。1998年四校合并后，由浙江大学化学系与原杭州大学化学系、浙江医科大学和浙江农业大学基础部化学教研室合并组建成新的浙江大学化学系。浙大化学系具有辉煌的历史，曾培养和造就了一大批杰出的学者。许多著名化学家如纪育沣、王葆仁、吴征铠、王序、卢嘉锡、汪猷、钱志道、徐光宪、钱人元、吴浩青、冯新德、杨福愉、沈家骢、陆熙炎、戴立信、谢学锦、沈之荃、徐承恩、陈耀祖、曹楚南、方肇伦、徐如人（兼）等22位中国科学院和中国工程院院士先后在该系学习或任教。
经过八十多年的奋斗，浙江大学化学系已发展成为综合实力雄厚、在我国具有重要影响的化学教学和研究机构。目前，浙江大学化学系是国家理科基础研究和教学人才培养基地,国家工科基础课程教学基地，设有化学博士后流动站，化学一级学科博士点（涵盖无机化学、有机化学、分析化学、物理化学和化学生物学等二级学科）。
化学系现有教职员工202人，其中教授46人（包括中科院院士3人，长江计划特聘教授2人，博士生导师36人），副教授72人。目前在校博士生180人，硕士生170人，本科生420人，在站博士后11人。
浙江大学化学系设有无机与材料化学研究所、分析化学与应用化学研究所、有机化学与药物化学研究所、物理化学研究所、催化研究所、分子设计及热力学研究所、微分析系统研究所、化学生物学研究所（筹）等8个研究所，在微流控分析技术、电化学、有机合成化学、热化学、分子工程学、有机催化等研究领域取得了多项国际水平的研究成果。目前，化学系承担了40多项国家973和863项目、国家自然科学基金重大、重点和面上项目。近两年年均到款科研经费达到1700万元，年均发表SCI收录研究论文220篇。
化学系设有化学实验教学中心，该中心仪器设备先进、齐全。建筑面积21000平米的现代化化学实验教学大楼已于2002年9月落成并投入使用。
进入新世纪以来，浙江大学化学系正在以求是、创新的校训精神，向国际一流这一宏伟目标迈进，并将为我国的化学教育和科学研究事业作出更大的贡献。
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