厦门医学高等专科学校是经国家教育部批准成立的一所公办医学类普通高等专科学校。学校创建于1953年9月，由当时闽南唯一的公立护士学校-厦门护士职业学校、厦门医士学校和厦门第二医院护士学校合并而成，“文革”一度停办，1972年复办。办学近60年来，经过几代人艰苦奋斗、自强不息、求真务实、开拓创新，初步建成了一所规模适度、结构合理、特色鲜明的医学高等专科学校。建校以来，已培养二万多名合格的卫生技术人才，为厦门及海西的医疗、卫生、教育事业做出了积极贡献。
学校现有校本部和两所条件较好的附属医院组成。设有医学、相关医学、护理和药学四大类十二个专业，全日制大专在校生2000人。学校以“规模不大，质量很高，录取分数高”而享誉全省，获国家卫生部、国家中医药管理局、国家人事部授予“全国卫生系统先进集体”称号。
地理环境介绍：学校位于“国际花园城市”――厦门，坐落在美丽的环岛干道旁，依山面海，环境优美，是求学治学的好地方。
学校特色：以突出实践教学和创品牌专业为重点，学校是国家级技能型紧缺人才培养基地；护理学专业是全国示范专业；口腔专业是省级精品专业，口腔专业实训中心是省级重点实训基地；口腔专业教学团队是省级教学团队，团队负责人是省级教学名师。
优势：2006年12月在接受教育部评估时，以“拥有一支高素质的师资队伍和优良的办学条件。”得到专家组的高度评价。专任教师135人，其中博士硕士74名，占55%；教授、副教授47名，占35%；在40%的专业课教师为“双师型”。师资队伍在同类学校中名列前茅。
教学组织：口腔系、护理学系、临床医学系、药学系、医学技术系、基础部。
实践教学基地：校外实践教学基地68个，其中教学见习、实习医院42所，技能实训基地11个。
合作交流：与新加坡达尔文教育有限公司、美国乔治亚州托马斯大学和塞班北玛利亚纳学院、菲律宾碧瑶大学等院校开展多方位多层次学术交流、文化交流和教学交流，建立了友好合作关系。
2009年5月与台湾嘉南药理科技大学签订友好合作协议，9月派出12名学生赴台湾嘉南药理科技大学学习，为期半年。
附属医院
综合性附属医院（厦门市第二医院）是一所三级乙等综合性医院，设病床802张，仪器设备总值超亿元。现有职工1270人，专业技术人员1026人，其中医学博士、硕士百余人，引进了来自英、美、德、韩等的海归博士及博士后多名。有四个厦门市重点学科。
附属口腔医院是一所二级达标专科医院，拥有进口口腔综合治疗机103台，仪器设备总值1500余万元。现有职工180人，专业技术人员103人，其中高级职称24人，博士学位2人，硕士学位12人，硕士研究生导师3人。有2个厦门市重点学科。
系部特色
护理学系
设护理、助产两个专业。护理专业是学校龙头专业，教育目标在于培养高职高专护理专业实用性、技能型人才，2006年建立与台湾厦门长庚医院“校院联合”办学的模式，引入台湾护理教育理念，灵活多变的护理教学方法，实行校内实训、见习、实习带教“校院一体化”，现已形成鲜明的专业特色。护理系在专业人才培养模式、课程体系创新及服务辐射能力等方面在省内达到领先水平，具有示范作用。
口腔系
设口腔医学、口腔医学技术两个专业，办学近30年，口腔系在师资队伍、专业课程设置、实训基地建设、教学内容创新、教学资源开发、教材编写等方面均达到省内一流。口腔专业教学团队2007年被评为省级教学团队，口腔技能实训中心获得省重点建设实训基地，口腔医学专业是福建省高等职业教育精品专业，有两门课程是省级精品课程，一门课程是市级精品课程。口腔系有两人获省级教学名师奖。
口腔医学技术专业长期与台资企业珠海维登陶齿有限公司合作办学，双方约定：1、珠海维登陶齿有限公司每年接收40名学生实习。2、对表现出色、成绩优异的学生颁发每月100―500元奖学金。3、每年择优录用部分学生。
药学系
药学系设有生物制药技术和药物制剂技术两个专业，是学校重点发展建设专业，药学系以重视学生的实践能力和就业岗位能力的培养为目标，突出职业教育与劳动就业的紧密结合，坚持学历证书和职业资格证书“双证并重”的办学特色，使学生在校期间通过一定的培训和考核，获得制药技术工种职业资格证书，提升就业竞争力。
临床医学系
临床医学系的教育目标在于为基层培养留得注用得上、信得过的应用型、创新型医学人才。临床系注重实践教学，引入全科医学理念。将临床医学系设在附属医院（厦门市第二医院），由医院承担学校临床医学专业学生的理论授课、实训、见习课程以及各专业的临床实习、毕业实习。毕业后可在城市社区卫生服务中心、农村乡镇卫生院等基层医疗单位从事医疗卫生工作,或在医学院校,医学科研单位及医疗卫生机构从事技术辅助工作的医学专业技术人才。
医学技术系
医学技术系设有卫生信息管理专业和眼视光技术专业。医学技术系在多家医疗机构，大型眼镜生产营销公司，软件公司建立了专业实习基地，并经劳动部门批准成立了计算机高新技术鉴定站和眼镜职业技能鉴定站。2008年与宝岛眼镜公司签订联合办学协议，由宝岛眼镜公司负责：1、接收毕业生。2、提供教学仪器设备。（目前已有价值28.36万元教学仪器设备在校使用）3、选聘专业课教师承担部分课程教学任务，承担学生见习及毕业实习任务。
基础部
基础部设医学基础与公共基础两个部分。医学基础实验教学中心资产上千万，拥有大体解剖数码互动实验室、显微数码互动实验室、病原微生物与免疫学实验中心、病理显微实验室、机能学实验中心、心理咨询中心、心理学实验室和心理健康教育培训基地。人体标本陈列室具有医学教学特色，各类标本1000余件。《人体解剖学与组织胚胎学》、《心理学》为省级精品课程。